From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Tue Feb 2 10:19:26 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Tue, 02 Feb 2021 10:19:26 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] =?iso-8859-1?q?posizione_postdoc_aperta_Universit?= =?iso-8859-1?q?=E0_degli_Studi_di_Napoli_Federico_II=2C_Dipartimento_di_A?= =?iso-8859-1?q?graria?= In-Reply-To: References: Message-ID: <20210202101926.73923ucc774xfuhq@inbox.unina.it> Cari tutti, è disponibile presso il Dip. di Agraria, Università degli Studi di Napoli Federico II una posizione per un assegno di ricerca. Il bando è già aperto ed ha scadenza 22 febbraio. Di seguito la descrizione del progetto: "We are hiring a post-doc on diet-microbiome interactions, background in bioinformatics or in anaerobic culturing of gut microbes both welcome. The project aims to study strain diversity and possible associations of different strains of key gut-related microbial species with eating habits, lifestyle and consumption of food products specifically designed for gut health and microbiome. The call is open with deadline February 22th: https://bandi.miur.it/bandi.php/public/fellowship/id_fellow/186179 For more details: Danilo Ercolini (danilo.ercolini a unina.it), Edoardo Pasolli (edoardo.pasolli a unina.it), Francesca De Filippis (francesca.defilippis a unina.it)." Con richiesta di diffusione. Saluti, Nunzio D'Agostino From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Wed Feb 10 11:13:18 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Wed, 10 Feb 2021 11:13:18 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] =?utf-8?q?indagine_su_disponibilit=C3=A0_di_neola?= =?utf-8?q?ureati_per_contratti_di_ricerca_bioinformatica?= Message-ID: Buongiorno dovendo programmare l'attribuzione di un assegno di ricerca tramite elixir bari e di contratti annuali tramite lo spinoff BROWSer diffondo, attraverso questa mailing list, i profili richiesti: *1. In attesa di pubblicazione di un bando per un assegno di ricerca professionalizzante finalizzato all'Upgrading delle banche dati Biologiche HmtDB (https://www.hmtdb.uniba.it ) e HmtVar (https://www.hmtvar.uniba.it ) chiedo la disponibilità di un laureato magistrale in Bioinformatica o Informatica con competenze in Python e nel Disegno e Implementazione di Banche dati Biologiche (assegno elixir).* *2. Ricerca laureati magistrali in Bioinformatica o in altre lauree per il cui conseguimento sia stato effettuato un percorso orientato a studi genomici e bioinformatici. Il laureato selezionato dovrà svolgere attività riguardanti analisi di dati disponibili in banche dati biologiche (TCGA, dbGAP e correlate) per il riconoscimento di geni target in progetti di disegno di farmaci. * Gli interessati possono rispondere a attimonellimarcella a gmail.com *Grazie* Marcella Attimonelli Spinoff BROWSer (https://browser-bioinf.com/) Dept of Biosciences, Biotechnology and Biopharmaceutics University of Bari -Italy Via E.Orabona 4 70126 Bari (IT) e-mail a ttimonellimarcella a gmail.com cell +393285686052 -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Wed Feb 10 20:55:47 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Wed, 10 Feb 2021 20:55:47 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] Galaxy Global course Message-ID: Dear all, I just wanted to let you know that a Global Galaxy Course will take place next week: https://shiltemann.github.io/global-galaxy-course/ It is a free, one-week long training, covering a wide variety of topics (not only genomics), even a choose your own adventure day! There will be tutorials and video recordings available, and online support in chat across all time zones. And of course, everyone is welcome to join! Please feel free to share it with people that you think might benefit from this training! Thanks, Bea From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Fri Feb 12 18:32:47 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Fri, 12 Feb 2021 18:32:47 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] =?utf-8?q?Webinar_=E2=80=98Data_mining_in_Aquacul?= =?utf-8?b?dHVyZSBhbmQgQmlvbWVkaWNpbmXigJkgMjLigJAyM+KAkDI0IEZlYnJ1YXJ5?= =?utf-8?q?_2021?= References: <7AD7AE11-6DC7-4704-AB50-1DF96C67182B@uniroma2.it> Message-ID: <7569607C-3199-4023-AC12-1B00FD0F6C85@uniroma2.it> Cari tutti, volevo chiedervi la cortesia di far circolare questa email sul webinar "Data mining in Aquaculture and Biomedicine? organizzato dalla Dott.ssa Boglione (boglione a uniroma2.it) del Dipartimento di Biologia di Tor Vergata (il pdf con tutti i dettagli in allegato). Ci sono ancora dei posti disponibili. Grazie mille e buon fine settimana Luana Luana Licata, PhD ELIXIR-Italy - Local Technical Coordinator (LTeC) MINT database coordinator Scientific database curator Bioinformatics and Computational Biology Unit, Dept. of Molecular Biology University of Rome Tor Vergata, Via della Ricerca Scientifica, snc 00133 Rome - ITALY http://www.moleculargenetics.it/bcb/ -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: -------------- parte successiva -------------- Un allegato non testuale è stato rimosso.... Nome: Biomedaqu COURSE SS4 Information for website complete draft.pdf Tipo: application/pdf Dimensione: 242194 bytes Descrizione: non disponibile URL: -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Mon Feb 15 12:32:40 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Mon, 15 Feb 2021 12:32:40 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] cnr_ns_on line il portale italiano dedicato al Covid-19 References: <29163F6F-0558-410F-ABC4-08E0C369B360@ibiom.cnr.it> Message-ID: <60B12EB5-6A8A-4E4C-AE0C-7DF5D7E67678@ibiom.cnr.it> Gentile collega, ti segnalo che è on line, all?indirizzo https://www.covid19dataportal.it/, l?Italian Covid-19 Data Portal, il portale italiano che mira ad esporre, in modalità aperta, i dati scientifici prodotti a livello nazionale su Covid-19 e Sars-CoV-2, promuovendone la condivisione. Realizzato da Elixir-it, nodo italiano dell?infrastruttura europea per la bioinformatica e i dati biologici coordinato dal Consiglio nazionale delle ricerche, intende favorire una più ampia collaborazione tra ricercatori, e rappresenta l?istanza italiana del portale realizzato su invito della Commissione Europea dall?European Bioinformatics Institute (EBI) e altri partner. In allegato una nota, per informazioni sono a disposizione Francesca De Leo (Cnr-Ibiom), email: francesca.deleo a cnr.it, cell. 392.8537451 e Graziano Pesole (Cnr-Ibiom), email: g.pesole a ibiom.cnr.it, cell. 331.1212317 (recapiti per uso professionale da non pubblicare). Grazie e buon lavoro Ufficio stampa Cnr: Francesca Gorini, francesca.gorini a cnr.it, cell. 329.3178725. Responsabile: Marco Ferrazzoli, marco.ferrazzoli a cnr.it, cell. 333.2796719; Segreteria: ufficiostampa a cnr.it, tel. 06.4993.3383 - P.le Aldo Moro 7, Roma -------------- parte successiva -------------- Un allegato non testuale è stato rimosso.... Nome: nota_elixir_cnr_garr_portal_covid.pdf Tipo: application/pdf Dimensione: 63863 bytes Descrizione: non disponibile URL: -------------- parte successiva -------------- From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Wed Feb 17 15:07:11 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Wed, 17 Feb 2021 15:07:11 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] Corso Carpentries On-line (in italiano): 19 e 26 Marzo 2021 Message-ID: Ciao a tutti, segnalo questo corso con preghiera di diffusione a chiunque possa essere interessato. Si tratta di un'edizione on-line ed in lingua italiana del Software Carpentry Workshop dedicato all'utilizzo di Python, Linux shell and Git per un audience di principianti. Il corso è gratuito. Al seguente link tutte le informazioni relative al corso ed alla modalità di iscrizione: https://carpentriesitalia.github.io/2021-03-19-italia-online/ Cordiali saluti, Loredana Le Pera. -- *ELIXIR-IIB Training * https://elixir-iib-training.github.io/website/ -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Mon Feb 22 12:40:36 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Mon, 22 Feb 2021 12:40:36 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] Webinar Series on Galaxy Advanced Features Message-ID: <28fe0d6a-444d-9a9f-7a8b-2048c12e98bf@gmail.com> Dear ELIXIR-Italy members, The Galaxy-ELIXIR community is organizing a *webinar series on Advanced Features*, starting on *Wednesday the 3rd of March at 5 pm CET*, for 4 consecutive weeks. The goal of this series is to raise awareness about features and functionalities in Galaxy that have remained unknown to most of the users, due to the rapid development of the Galaxy ecosystem. Schedule: * March 3rd: Advanced Galaxy workflow features. * March 10th: Processing thousands of datasets simultaneously. * March 17th: Jupyter Notebooks and RStudio in combination with Galaxy. * March 24th: Speed up your data analysis with Galaxy. The *registration* is now open at: https://elixir-europe.org/events/galaxy-elixir-webinars-series-advanced-features As a side note, we are also hosting the last webinar of the series *'Open Data Infrastructures to tackle COVID-19 pandemic' this Wednesday at 5 pm CET*, under the title 'DRS, long-read-sequencing, proteomics and more ? an update to recent COVID-19 workflow developments'. Please also feel free to spread the word, everyone is welcome to join! Kind regards, Hans-Rudolf and Bea -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Thu Feb 25 12:01:56 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Thu, 25 Feb 2021 12:01:56 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] Fwd: bioinformatician/biostatistician position at UNITO In-Reply-To: References: Message-ID: Buongiorno, ci piacerebbe poter segnalare alla comunità Elixir-ITA questa posizione che verrà aperta a breve a Torino. Cordiali saluti Piero Fariselli e Giuseppe Matullo *BIOINFORMATICIAN/BIOSTATISTICIAN POSITION* We are looking for a candidate to work in the frame of the INTERVENE project (https://www.interveneproject.eu/), a 5-year 10 million ? EU funded project that aims to develop and test next generation tools for disease prevention, diagnosis and personalized treatment utilizing the first US-European pool of genomic and health data and integrating longitudinal and disease-relevant -omics data into genetic risk scores. The candidate will analyze genome-wide association studies and next generation sequencing data aiming at developing tools, including new AI methodologies, to help clinicians and clinical geneticists in making genetically informed decisions in their choices for treatment and cancer screening. Qualification and requirements: · Degree with a strong mathematical and statistical background applied to genetics of complex diseases · PhD and expertise related to the analysis of NGS and omics data · Good written and verbal communication skills in English · Ability to work in a multidisciplinary team as well as the ability to work independently Salary will be commensurate with the expertise and can extend up to 3 years within the project. Please send *by March 20th* an e-mail including Curriculum Vitae to: Prof. Giuseppe Matullo, Ph.D. Genomic Variability, Complex Diseases and Population Medicine Department of Medical Sciences University of Study of Turin Via Santena 19, Torino Phone: 39-011-6705601 e-mail: giuseppe.matullo a unito.it -- Piero Fariselli Dept. Medical Sciences Via Santena, 19 - 10126 Torino, Italy tel: +39 011 6705871 -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: -------------- parte successiva -------------- Un allegato non testuale è stato rimosso.... Nome: bioinformatician_biostatistician position_UNITO_GM.pdf Tipo: application/pdf Dimensione: 416922 bytes Descrizione: non disponibile URL: From elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it Thu Feb 25 16:21:36 2021 From: elixir-ita_ml.elixir-ita.cnr.it a srv00.area.ba.cnr.it (General ELIXIR-Italy Mailing list) Date: Thu, 25 Feb 2021 16:21:36 +0100 Subject: [ELIXIR-ITA_ml] Post-doc position available at UNIMIB on algorithms in pangenomics Message-ID: Dear all, we are looking for a post-doc at the Bioinformatics and Experimental Algorithms lab (https://www.algolab.eu) of the University of Milano-Bicocca (Milan, Italy) working on "Efficient algorithms in computational pangenomics''. The main focus is on graph-based representations of pangenomes and their applications to transcriptomics and tumor evolution. The research activity will focus on designing, implementing and analyzing, both from a theoretical and experimental point of views, new combinatorial algorithms for problems for novel alternative splicing event inference and quantification, for pangenome comparison, for evolutionary history construction and comparison. The candidate will be part of the PANGAIA EU-funded project ( https://www.pangenome.eu/) and she/he will have the opportunity to collaborate with partners of the project by being seconded to them. There will be an increment of the salary during the visit period to cover the additional expenses. The position is for one year, to start in May 2021, and the annual salary is 30,000? before taxes (approx. 1,650?/month after taxes). The public call will be published soon at: https://www.unimib.it/concorsi/collaborazioni-per-la-ricerca-e-di-supporto-alla-didattica/assegni-di-ricerca/assegni-ricerca-posizioni-aperte Please do not hesitate to contact me (Yuri Pirola ) for more information. Yuri Pirola -------------- parte successiva -------------- Un allegato HTML è stato rimosso... URL: